La Administración Portuaria Integral de Quintana Roo (Apiqroo) aclaró que no existe ningún proyecto para construir un muelle de cruceros en Puerto Morelos. El director de la dependencia, Vagner Elbiorn Vega, señaló que únicamente se han realizado estudios de prefactibilidad en la zona de Punta Brava para un muelle de carga.
Explicó que el puerto tiene limitaciones naturales, como un calado de cuatro metros y la cercanía con el arrecife, considerado área protegida. Los estudios determinaron que es viable un muelle de carga, pero el proyecto se encuentra todavía en fase preliminar y requiere la opinión de instancias federales antes de avanzar hacia un anteproyecto.
En agosto de 2025, Apiqroo contrató a la empresa Proyectos y Estudios de Ingeniería S.A. de C.V. para trabajos técnicos, topográficos y de mecánica de suelos. La propuesta contempla una inversión superior a 64 millones de dólares y se enmarca en el Programa Maestro de Desarrollo Portuario 2024–2029. El objetivo es reducir sobrecostos logísticos en Quintana Roo y convertir a Puerto Morelos en un nodo estratégico de comercio y energía.